Die Regulierung der Junghans Mysterieusen ist durch mehrere unterschiedliche Einstellungen zu bewerkstelligen. Es ist dabei wichtig, die einzelnen Einstellungen strikt in der im Folgenden beschriebenen Reihenfolge vorzunehmen.
Grundsätzlich ist die richtige Einstellung folgender Komponenten vorzunehmen:
1. Regulierung der Länge der Auflagestifte
2. Zentrierung der Uhr im Ruhezustand
3. Einstellung des Winkels zwischen der Längsachse des Kurzpendels und der Mittelsenkrechten der Ankerplatte
4. Korrektur des Hauptgewichts
5. Korrektur der Pendellänge
Vor einer Regulierung sind die im Kapitel „Reparatur und Restaurierung“ beschriebenen Schritte sämtlich durchzuführen und die Uhr ist wieder komplett aufzubauen.